【提要】
本难论述肾与命门的关系和命门的功能。并提出了左为肾，右为命门的论点。
【原文】
三十六难曰：脏各有一耳，肾独有两者，何也？
然：肾两者，非皆肾也。其左者为肾，右者为命门。命门者，诸精神之所舍①，原气②之所系也；男子以藏精，女子以系胞③。故知肾有一也。
【语译】
三十六问：五脏各只有一个，惟独肾脏是两枚，这是什么道理呢？
答：肾脏有两枚，并不是都称为肾，它在左边的称为肾，在右边的称为命门。命门，是全身精气和神气藏舍的地方，也是原气维系的地方，男子用以蓄藏精气，女子用以维系胎胞，所以知道肾脏仍只有一个。
【注释】
① 诸精神之所舍：《集解》：神精“应据三十九难改作精神”。《五行大义》卷三引《八十一问》“舍”作“会”。
② 原气：维持人体生命活动的根本。包括原阳、原阴，统称为原气。张仲景说：“命门为原气之根，为水火之宅。五脏之阴气，非此不能滋，五脏之阳气，非此不能发。”
③ 胞：指女子胞，即子宫。
【按语】
命门学说首创于难经。在此之前，《内经》中虽已提出“命门”一词，但概念则完全不同。如《灵枢·根结》篇：“太阳根于至阴，结于命门。命门者目也。”《灵枢·卫气》篇：“足太阳之本，在跟以上五寸中，标在两络命门，命门者目也。”都是指目而言之。
本难提出左为肾，右为命门，以说明肾有两枚。这里所说的左右，并不是指人体的具体部位，中医脏象学说的五脏及其功能，都不能作为西医解剖部位的五脏去理解。“命门者，诸神精之所舍，原气之所系也，男子以藏精，女子以系胞。”故肾与命门，应该从肾脏包括肾阴与肾阳两方面的功能去认识。肾阴和肾阳关系到人的生长、发育、生殖和维持全身各个脏腑的生理活动，换句话说，全身各脏腑和器官都需要肾阴的滋养和肾阳的温煦，所以又叫“元阴”、“元阳”、“先天之本”。后世医家，尤其明代以后，对肾与命门从理论上作了很多阐发，命门理论至今对临床实践都有着重要的指导意义。