或问余子曰：《灵素商兑》何为而作耶？
曰：发《灵枢》、《素问》之谬误也。
曰：自人体解剖之学盛，而筋骨之联络，血管、神经之分布，脏腑之位置、功能大明；自显微镜之制兴，而四体百骸之微妙，无不显露。于是乎官骸脏腑之关系日明，而生理、病理之本源流末，渐得其真相。至于今日，大都已为定论，洞然豁然，不容疑虑。《灵枢》、《素问》，数千年前之书，以粗率之解剖，渺茫之空论，虚无恍惚，其谬误可得而胜发乎？
曰：撷其重要而尚为旧医称说之中坚者而摧之也。
客曰：空谈不敌事实，今者新医日盛，见地日确，前古荒唐无稽之学，将日就湮没而自尽，不攻而自破，此篇不作可也。
曰：灵素之杀人，四千余年于兹矣。今幸真理日明，混沌荒谬之说日就衰微，而蓬曲拘滞之士、固强顽钝之人，犹复据守残喘，号召于世，日以汤药圭刀戕人之生，夺人之命，鳏寡人之夫妇，孤独人之子，其惨狠阴毒有过于盗贼、虎狼、兵戎、刀锯、汤火、枪炮者矣。昔然明有言曰：“爱民如子，见不善者，驱之如鹰鹯之逐鸟爵也。”吾辈以活人仁人为术，急起而直追，斩艾余柴，使群趋实学，勿为空论，以登斯民于寿域，天职也，义务也，仁术也，如之何其勿急也？
曰：自岐黄而降，阐发灵素者，代有其人，扁鹊、仓公、仲景、华佗、紫虚、丹溪、同父、东垣、景岳、濒湖，瞽说充栋，皆为近世旧医之城社，顾独掊击灵素，何也？
曰：堕其首都也，塞其本源也。大抵吾国人之心理，重古而轻今，笃旧而疑新，避实而遁虚恶中庸而喜高玄，无明确之实验，无巩固之证据，以意左右，人异其说，聚讼千载，迄无定论，其最终之目的、最高之城府，则在引证吉言以为护身之符，而不问实物、真相、是非、合不合也。余杭章氏太炎，号称知新，而其所著《西医平议》，根据《内经》以驳今日解剖，即此可睹。他人又何论乎？是故积数千年而国势不长，学术不进，儒螫于思孟，医锢于岐黄，凿空逃虚，不征事实，其中毒久矣。不歼《内经》，无以绝其祸根，仓鹊而下，无讥可也。
客曰：西学东渐，国势日蹙，有志之士，日嚣嚣焉以保存国粹为急务。吾国医学发源最古，岐黄而后，世有哲人，技之精者，几于起死回生。史传所载，私乘所记，不可谓尽诬也。即今乡曲之中，目不识丁者，持草药以治蛇虫之蚕，亦往往验焉。夫以四千余年相承继之学问，代有发明，高文典册，裒然成帙，奏功驱疾，往往而效，将必有至理存乎其间，好学深思，表而出之，以发挥祖国之光辉，岂非爱国志士所宜任哉？而子乃欲一笔抹煞之，无乃忍乎？
曰：客能知此，可与议论矣。兹吾所为急欲掊击灵素也。夫所谓国粹者，何也？国所与立之精神也。吾国吾种，四千余年，治乱兴废，至今尚存者，其立国精神，乃在旧医乎？粹者，美之之辞。无美足扬，徒以其历史之久，蔓延之广，震而惊之，谓之国粹，是何以异于蛣蜣之宝粪土、鸱鸮之吓腐鼠耶？彼妇女缠足之风，轻盈莲步，何乃不谓之国粹而保之耶？几千年专制君主政体，亦有尧、舜、禹、汤、文、武、汉文帝、唐太宗之治，何乃不谓之国粹而保之耶？彼旧医之所陈述，骨度、脉度、筋度、内景，皆模糊影响，似是而非，质以实物，关口夺气，无余地可以置辩也。称道阴阳，陈设五行，下与祝卜、星相、瞽巫为伍，故古多以巫医并称，则固世人所轻视，非有国粹之价值也。
其所以治疗有效者，则数千年以人命为尝试，积之既久，幸中偶合者，日益加多，犹多言之必有中也。黠者网络成绩，勒为成书，以诏来兹，后起者循而为之，往往合焉。而无坚固不拔之原理以为之基，无精确详密之研究以作之证，故界限不明，分别不严，源流不悉，诊断不确，治疗不定，结果不知，差以毫厘，失之千里，同一药石，活人杀人，不能预卜，幸而中病，或能起痼；不幸而药不对症，虽良方亦足以害人。至其何以活人，何以杀人，何以中病，何以不对症，医人者不知也，徒以阴阳五行生克之说，补泻佐使之论敷衍了事，凿七日而混沌依然。此其弊在无精确之理论实验，不能悉疾病之真态，不知药物入于体内作如何化学、物理学之影响也。故虽有良药奇方，由之而不知其道，历千余年而尚在朦胧恍惚之中。夫病疾者，人命生死攸关之事，而以恍惚无凭之技尝试之，岂非大危事哉？是故吾国之药物容有良品，处方亦容有奇验者。
四千余年来之经验，诚有不可厚非，而无如其学说理论则大谬，而无有一节可以为信。皮之不存，毛将焉附？乃至蛇蝎蛮啮，乞灵于乡曲目不识丁之徒，虽欲发表其功绩，将若何而言之？为今日计，惟有扑灭一切不根之虚说，导来者以入于科学实验之途，以今日生理、病理、医化学、药物学等研究法，发我宝藏，或有闪烁宇宙之望乎已而已！而循旧医之道，吾国医学永无光明之日，虽欲保之，将奈之何哉？将奈之何哉？
灵素非黄帝书也，绎其词气，籀其文章，盖战国秦汉诸子之流亚也。其中祖述前言，非无轩辕遗训，而皆托之黄帝，斯为过耳。历代者，如朱晦庵等，皆有讥议。余著此篇，不备引以为犄角之援者，盖不欲乞灵古人，斗空论以相胜，而蹈前人之覆辙也，凡欲以征实而已。