灵素中所云五藏六府者，大体皆以肝、心、脾、肺、肾为五藏，胆、胃、大肠、小肠、膀胱、三焦为六府（《素问·金匮真言篇》）。原其所以区别脏腑之界说，与其命名之意，则《素问·五脏别论篇》有定义焉，其言曰："所谓五脏者，藏精气而不泻也，故满而不能实；六腑者，传化物而不藏，故实而不能满也。"释之者曰："精气为满，水谷为实。精气质清，藏而不泻，故但有充满而无积实。水谷质浊，传化不藏，故但有积实而无充满。"然则灵素之所谓五脏六腑者，其意义燎然可明矣。彼以为肝、心、脾、肺、肾者，剖之而肥厚多实质，或不见空洞，不睹他物，又不得其出入之路，于是以为但有精气流行充满于其间，而无传化疏泄之用，藏而不泻，故名之为脏。胆、胃、大小肠、膀胱、三焦皆为囊橐腔洞之形，或贮液体，或贮固体，而胆、胃、膀胱又显然有出入之口，乃以为司传化疏泄之机，充实他物之库，故名之为府。此其谬误，凡稍知生理、解剖者，皆能晓然。今请逐条驳之。
肝者，乃为胆汁、尿酸、糖质之制造所也，又有消灭门脉血液毒力之用。细检其结构，有胆汁细管发自肝细胞，而开口于胆管，所以输送胆汁于胆囊也。是则肝也者，摄取由肠管而来之诸材料，制成胆汁，泻之于胆囊，更由是而泄之于肠也。藏乎？泻乎？彼不知肝之医化学作用，又徒以肉眼检查其解剖，不能得肝胆联络之路之有胆汁细管，遂妄意其藏而不泻。在古人，则科学未明，器械未精，无足深怪；至于今日，而又墨守旧说，而祇敬之曰：是《灵枢》、《素问》之言也。精粗、疏密、是非之莫辨，妄人而已矣。
心者，有房有室，能张驰嘬掩以输血液，右房与大静脉相连，左室与大动脉相接。自静脉还流之血液，挟种种培养物质，注之右房，右房受之，输之右室，右室输之肺，又与外界之空气相结合，而摄其酸素，输之左房，经左室而入于大动脉，周浃全身，授培养物质与酸素于四体百骸，而血液乃复从经毛细管，归于静脉，循环不息，周而复始。是心居动、静两脉之中间，而为血液流动灌输之枢机，虽似藏而实泻，名之曰藏，失其体用矣。
灵素之所谓脾者，吾不知其何所指，《素问·阴阳应象大论》及《五运行大论》两言“血生脾”，似与血液有关。今日之所谓脾者（Milz），主生白血球、尿酸，而泻诸静脉者也（时亦生赤血球），则宜曰“脾生血”，且非藏而不泻者也。其余他篇，悉以脾胃并言。《素问·厥论》曰：“脾主为胃行其津液者也。”《灵兰秘典论》曰：“脾胃者，仓廪之官。”《太阴阳明论》曰：“脾藏者，常著胃土之精也。”《灵枢·本输篇》曰：“脾合胃。”其余不可悉举。而“血生脾”之句，王冰以为即火生土之说。然则灵素所谓脾者，全乎消化器官之系，似与今日之所谓脾者（Pancreas）相似。而今日之脾，主制造发酵素，而泻之于十二指肠，亦泻而非藏。要之，无论为今日之脾，今日之脾，而谓之藏而不泻，则大谬矣。
肺者，呼吸空气，掌气体出人之职，取外界酸素，授之于血；取血中碳酸气，泄之于外。界其出入之路，为气管、气管枝、鼻、咽喉，而肺又受右心之血液，注之左心，其泻而不藏明矣，名之曰藏，斯为不得其当矣。
肾者，其中亦有腔，今谓之肾盂。肾之实质中，有细尿管蜿蜒纡行。凡身内他部之废物疏泄之于肾，肾受之而成尿，由细尿管泻之于肾盂，然后人于输尿管，泄诸膀胱，由膀胱经尿道而外溺者是也。是则肾亦非藏而泻者，不得谓之藏矣。
至于胆，其作用掌司，上已言之，纯乎泻者也，属之六府，本与其定义相符。而《素问·五脏别论》又以胆为藏而不泻，既属诸府，又谓藏而不泻，抵牾矛盾，自乱其例，莫此为甚。此其故在于检查、解剖之粗率，而不知有输胆管之开口于十二指肠也。
胃、大肠、小肠、膀胱谓之府，与其定义相符。
三焦者，其名已奇，灵素又无明豁之解说，故《难经》以为有名无形，东垣分手三焦、足三焦而为二，徐遁陈无择以为有脂膜大如掌，正与膀胱相对，此皆与《内经》之义不合。惟虞天民以为其体有脂膜，在腔子之内，包罗乎五藏六府之外者即是；张景岳以为体腔周围上下全体若大囊者，即为三焦，以其贮盛藏府，故亦谓之府。综此二说，则三焦云者，合胸腔、腹腔而言，然则即肋膜、腹膜之谓也。夫肋膜、腹膜何所盛受，何所泄疏而乃定以为腑？且曰“三焦者，中渎之腑，水道出焉”（《灵枢·本输篇》），试问：所出何水？出自何道耶？其亦不经甚矣。
脏腑之定名称类，其疏忽谬误既如此矣，虽灵素亦不能自持其说也。《素问·五脏别论》曰：“脑、髓、骨、脉、胆、女子胞，此六者，地气之所生也，皆藏于阴而象于地，故藏而不泻，名曰奇恒之腑。夫胃、大小肠、膀胱、三焦，此五者，天气之所生也，其气象天，故泻而不藏，此受五脏浊气，名曰传化之腑，此不能久留，输泻者也。魄门亦为五脏使，水谷不能久留。”此文之所谓女子胞者，指子宫而言；魄门者，肛门也。是又以脑、髓、骨、脉、胆、子宫为六藏，胃、大小肠、肋膜、腹膜、膀胱、肛门为六腑，与全书所主张者大相刺谬。嗟乎，不求实征，而以空想为左右，宜其多扞格不通，彷徨失据，而不能自坚其说也。经且不能自信，而后人顾深信不疑，取糠秕糟粕而莫敢谁何，岂非大愚不灵者乎？